- Az MR vizsgálatnak semmiféle hosszú távú káros hatása nincs az emberi szervezetre.
- Az MR vizsgálat mágneses térben történik, ezért azoknál a betegeknél, akiknek pacemakert (szívritmus szabályzó) ültettek be, az MR vizsgálat nem végezhető el.
- A terhesség első harmadában (trimeszterében) a fejlődő magzat fizikai hatásokra nagyfokú érzékenysége miatt MR vizsgálat elvégzése nem javasolt. A vizsgálat csak abban az esetben végezhető el, ha az anya, vagy a magzat szempontjából elengedhetetlenül fontos. Ebben az esetben a vizsgálatot megelőzően fontos a radiológus és a klinikus egyeztetése.
- A kontrasztanyag okozhat kisebb allergiás reakciót, megjelenhet enyhe bőrpír, kiütések, viszketés, ezek igen enyhe reakciók, amik perceken belül el is múlhatnak. Ezen kívül előfordulhat pl. melegségérzés, hányinger vagy émelygés és vizelési inger. Nagyon ritka esetben fordulhat elő súlyosabb allergiás reakció (anafilaxiás sokk). Elhárítására felkészültek vagyunk.